Active Motif’s Basepair Portal

Active Motif’s Basepair Portal

ATAC-Seq, CUT&TagおよびChIP-SeqのNGSデータを解析、可視化する自動ツール

概要

Active MotifはBasepairと提携して、ATAC-Seq、CUT&Tag、およびChIP-Seqのデータ解析法を変革します。Basepairは、クラウド上に構築された自動化パイプラインを持つ、高速で使いやすい次世代シーケンス解析のプラットフォームです。数千サンプルの並列解析にも対応し、データ解析を効率化します。Active Motif’s Basepair Portalは、Active Motifのキットで作製したサンプルを解析するための特別なポータルサイトです。このポータルサイトには、ATAC-Seq、CUT&Tag、ChIP-Seqの解析パイプラインがあります。

Active MotifのATAC-Seq、CUT&Tag-IT™ Assay、および ChIP-IT High Sensitivity® キットで作成したシーケンスデータは、Active Motif’s Portal on Basepairを使って無料で解析できます。

対象となるATAC-Seq KitCUT&Tag-IT Assay Kit、およびChIP-IT High Sensitivity® KitにはActive Motif’s Basepair Portalへのご案内が入っていますのでご確認ください。各Kitで作製できる16サンプル分のバイオインフォマティクスが無料で提供されます。キットに案内が入っていない場合はjapantech@activemotif.comまでご連絡ください。

アクセスコードをお持ちの方は下のボタンをクリック

Active Motif’s Basepair Portalの使用法

  1. こちらからポータルにアクセスし、アクセスコードを入力してください。アクセスコードをお持ちでない方はこちらのフォームにご入力ください。折返しコードをお伝えします。
  2. Basespace、NCBI GEO/SRA、またはご自身のサーバーから、ご自身で取得したシーケンスのfastqファイルをアップロードまたはインポートします。
    Basepair upload
  3. レポートを生成するために解析を実行します。
    Basepair reporting
  4. インタラクティブなグラフィック結果をご覧ください! ATAC-seqのデータを用いたデモをこちらから覧いただけます。
    • 4.1 Heatmaps
      Basepair heatmap data
    • 4.2 Genome Browser
      Basepair genome browser data

利点

このオンデマンド解析は、以下のことを可能にします。

  • すべてのデータのバイオインフォマティクス解析は数時間で完了します。
  • データサイズや複雑さに関わらず、待ち時間なしで解析できます。
  • すべての図やグラフはインタラクティブなので、求める答えや知見をより早く見つけることができます。
  • 論文に掲載可能な体裁で、明確な結果を得ることができます。

アクセスコードの取得

Order ATAC-Seq Kit, CUT&Tag-IT Assay Kit、またはChIP-IT High Sensitivity®のご購入後にアクセスコードをお届けします。これらのキットをご購入されたらこちらのフォームにご入力ださい。