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DNA Library Prep Kit for Illumina® の概要
DNA Library Prep Kit for Illumina®
Dual Index Primers Set 1 for for Illumina®
Dual Index Primers Set 2 for for Illumina®DNA Library Prep Kit for Illumina (Cat No. 53220) は、Active MotifのChIP-Seq KitおよびChIC/CUT&RUN Assay Kitなどで得られたdsDNAテンプレート用に最適化されているため、効率的なライブラリー調製が可能です。また、 DNA Library Prep Kitには48反応分のライブラリー調製試薬とDNA精製・サイズセレクションを行うためのSPRI磁性ビーズ試薬が含まれています。
Dual Index Primers Set 1 (Cat No. 53221)およびSet 2 (Cat No. 53222)により、Illuminaシーケンサーシステムのフローセルで最大96反応までのマルチプレックスが可能です。
DNA Library Prep Kit for Illumina Performance
- 0.5 ngから10 ngのdsDNAに対応
- 一貫性のあるフラグメントサイズ
- 1チューブによるライブラリ作製反応
- ChIP-SeqやCUT&RUNに最適
DNA Library Prep Kit for Illumina 推奨キット:
- ChIC/CUT&RUN Assay Kit
- ChIP-IT High Sensitivity
- Low Cell ChIP
- 5hmC Profiling Kit
- MethylCollector MBD Capture Kit
DNA Library Prep Kit for Illumina Workflow
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DNA Library Prep Kit for Illumina® の構成品
DNA Library Prep Kit for Illumina (Cat. No. 53220)
- End Repair Buffer, store at -20°C
- End Repair Enzyme Mix, store at -20°C
- Illumina Adapter, store at -20°C
- T4 DNA Ligase, store at -20°C
- Q5 Polymerase NGS MM, store at -20°C
- TT Buffer, store at RT
- SPRI Beads, store at 4°C
- PEG, store at 4°C
Dual Index Primers Set 1 for Illumina (Cat. No. 53221)
- AM i5-001 Primer, store at -20°C
- AM i5-002 Primer, store at -20°C
- AM i5-003 Primer, store at -20°C
- AM i5-004 Primer, store at -20°C
- AM i5-005 Primer, store at -20°C
- AM i5-006 Primer, store at -20°C
- AM i7-001 Primer, store at -20°C
- AM i7-002 Primer, store at -20°C
- AM i7-003 Primer, store at -20°C
- AM i7-004 Primer, store at -20°C
- AM i7-005 Primer, store at -20°C
- AM i7-006 Primer, store at -20°C
- AM i7-007 Primer, store at -20°C
- AM i7-008 Primer, store at -20°C
Dual Index Primers Set 2 for Illumina (Cat. No. 53222)
- AM i5-007 Primer, store at -20°C
- AM i5-008 Primer, store at -20°C
- AM i5-009 Primer, store at -20°C
- AM i5-010 Primer, store at -20°C
- AM i5-011 Primer, store at -20°C
- AM i5-012 Primer, store at -20°C
- AM i7-001 Primer, store at -20°C
- AM i7-002 Primer, store at -20°C
- AM i7-003 Primer, store at -20°C
- AM i7-004 Primer, store at -20°C
- AM i7-005 Primer, store at -20°C
- AM i7-006 Primer, store at -20°C
- AM i7-007 Primer, store at -20°C
- AM i7-008 Primer, store at -20°C
DNA Library Prep Kit for Illumina® Data
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Figure 1. DNA Library Prep Kit for IlluminaによるCTCFをターゲットとしたCUT&RUNのライブラリー品質
500,000個のK562細胞に対し、CTCF（Cat.No.91285）をターゲットとするChIC/CUT&RUN Assay Kit（Cat.No.53180）をトリプリケートで実施したIGV Browserトラックを示す。ライブラリーは、DNA Library Prep Kit for Illumina（Cat.No.53220）または他社製ライブラリー調製キットを用いて作製し、CTCFのENCODE ChIPデータと比較した。
(Click image to enlarge)Figure 2. DNA Library Prep Kit for IlluminaによるH3K4me3 をターゲットとしたCUT&RUNのライブラリー品質
500,000個のK562細胞に対し、H3K4me3（Cat.No.39060）をターゲットとするChIC/CUT&RUN Assay Kit（Cat.No.53180）をトリプリケートで実施したIGV Browserトラックを示す。ライブラリーは、DNA Library Prep Kit for Illumina（Cat.No.53220）または他社製ライブラリー調製キットを用いて作製し、H3K4me3のENCODE ChIPデータと比較した。
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Figure 3. DNA Library Prep Kit for Illuminaと他社製ライブラリー調製キットの相関を示したヒートマップ
H3K4me3をターゲットとしてCUT&RUN (n=3) を実施した結果、 DNA Library Prep Kit for Illuminaと他社製ライブラリー調製キットの比較から、強い相関があることが確認できる。
(Click image to enlarge)Figure 4. DNA Library Prep Kit for Illuminaで調製したChIP-Seqデータ
ChIP-IT High Sensitivity（Cat.No.53040）を用い、 CTCFをターゲットとしてトリプリケートで実施したIGV Browserトラックを示す。ライブラリーは、DNA Library Prep Kit for Illuminaまたは他社製ライブラリー調製キットにより作製している。
(Click image to enlarge)Figure 5. dsDNA量に対する適応性について
0.5、1、10 ngの大腸菌由来DNAからDNA Library Prep Kit for Illuminaを用いてライブラリーを調製し、シーケンスを実施した。それぞれのdsDNA量において、他社製ライブラリー調製キットと同等の結果となっていることがわかる。
DNA Library Prep Kit for Illumina® Documents
DNA Library Prep Kit for Illumina Manual [Japanese]
