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ChIPキット選択ガイド

特定の転写因子や少量・取り扱いが難しい試料、オープンクロマチン領域やヒストンマークの解析など、さまざまな実験条件があります。こうした条件に応じて、アクティブ・モティフのChIP選択ガイドが適切な製品選びをサポートします。また、こちらをクリックすると、ChIPキットの全ラインナップをご覧いただけます。

サンプルの種類は？

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培養細胞

1) サンプルの種類 2) ChIPやCUT&RUNの検証済抗体の有無 3) サンプル必要量 4) クロマチンの断片化 5) キットの特長 6) 推奨キット
培養細胞 ⇨CUT&RUN検証済抗体あり ⇨転写因子: 25-500K
ヒストン: 5-500K		 ⇨標的型MNase ⇨2 Day プロトコル ⇨CUT&RUN
#53180
⇨ChIP検証済抗体あり ⇨転写因子: 50-100K
ヒストン: 1-100K		 ⇨超音波処理 ⇨少量サンプルに対応 ⇨Low Cell ChIP
#53086
⇨100K以上 ⇨超音波処理 ⇨転写因子など低存在性比のターゲットに対応 ⇨ChIP-IT High Sensitivity
#53040
⇨1 Day プロトコル ⇨ChIP-IT Express
#53008
⇨酵素処理 ⇨1 Day プロトコル ⇨ChIP-IT Express Enzymatic
#53009
⇨TIP-ChIP検証済抗体あり (ChIP検証済抗体も使用できる場合あり) ⇨300K - 1M per well ⇨タグメンテーション ⇨Tn5によりインデックス化した多サンプルを同時にChIP解析 ⇨TIP-ChIP Assay Kit
#53211
⇨なし ⇨6M ⇨超音波処理 ⇨ChIP検証済み抗体は不要 (AMタグ抗体でプルダウン) ⇨Tag-ChIP-IT
#53022

 

凍結組織、PBMC

1) サンプルの種類 2) サンプル必要量 3) キットの特長 4) 推奨キット
新鮮/急速凍結　組織 ⇨転写因子: 10-20 mg
ヒストン: 0.2-20 mg		 ⇨少量サンプルに対応 ⇨Low Cell ChIP
#53086
⇨100+ mg ⇨転写因子など低存在比のターゲットに対応 ⇨ChIP-IT High Sensitivity
#53040
⇨1 Day プロトコル ⇨ChIP-IT Express
#53008
PBMCs ⇨10M cells ⇨PBMC (末梢血単核球) 免疫細胞などに対応 ⇨ChIP-IT PBMC
#53042

 

オープンクロマチン解析

1) サンプルの種類 2) サンプル必要量 3) キットの特長 4) 推奨キット
培養細胞 ⇨1-100k ⇨NGS用DNAライブラリーまで調製可能 ⇨ATAC-Seq Express Kit
#53157
新鮮/急速凍結組織 ⇨20-30mg ⇨NGS用DNAライブラリーまで調製可能
固定化細胞 ⇨50-100K ⇨ホルムアルデヒド固定細胞に対応 ⇨Fixed Cell ATAC-Seq Kit
#53151

 

少量サンプル

1) サンプルの種類 2) 解析対象 3) サンプル必要量 4) キットの特長 5) 推奨解析リード数 6) 推奨キット
培養細胞 ⇨転写因子またはヒストン ⇨5-500K ⇨標的型MNaseによる切断 ⇨800-2500万 ⇨CUT&RUN
#53180
⇨転写因子 ⇨50-100K ⇨少量サンプルに対応 ⇨2000-5000万 ⇨Low Cell ChIP
#53086
⇨ヒストン ⇨5-100K ⇨NGS用DNAライブラリーまで調製可能 ⇨800-1000万 ⇨CUT&Tag-IT Express
#53175
組織 ⇨ヒストン ⇨0.5-10mg ⇨NGS用DNAライブラリーまで調製可能 ⇨800-1000万 ⇨CUT&Tag-IT Express #53175
Tissue Prep for NGS Assays #53185

 

サンプルの種類やターゲットに応じた最適なキット選びについて

サンプル量が限られている場合でも、最適化されたキットにより、高品質なChIPやクロマチンプロファイリングを行うことができます。

  • Low Cell ChIP Kit — ソートされた細胞やマルチオミクス解析用に分画された集団など、小規模または希少なサンプルから転写因子のChIP解析を行うために設計されています。
  • CUT&Tag-IT® Express Assay Kit — 少ないサンプル量からでもヒストン修飾をプロファイリングでき、DNAライブラリ調製も簡単なステップで行えます。

どちらも低いバックグラウンドで信頼性の高い結果を提供し、希少な細胞集団や少量のサンプルを扱う場合に適しています。

ChIP-IT® High Sensitivity Kitは、内在性の低い転写因子を検出・濃縮するために特別に最適化されています。改良されたクロマチン調製法と抗体結合条件により、サンプル量が限られている場合や発現が低いターゲットの場合でも、信頼性が高いChIPの解析結果を得ることが可能です。

ChIP-IT® Express Kitは、操作時間や処理ステップを効率化するため、プロトコールを最適化しています。その結果、高い回収率と再現性を保ちながら、クロマチン調製、免疫沈降、DNA精製までを1日で行うことが可能です。（NGS用ライブラリ調製は別途必要です）

ChIPで検証済みの抗体などがない場合、Tag-ChIP-IT® システムにより、任意のタンパク質のC末端にAMタグを付加して発現させることでChIPを行うことができます。AMタグは、特異性の高いChIP解析が行えるよう設計されているため、適切な抗体が存在しない場合でもChIP解析を可能にします。

ChIP-IT® PBMC Kitは、末梢血単核球 (PBMC) を効率的に溶解するために最適化したbuffer構成で、高品質なChIPデータが得られるように設計されています。

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