Single-Cell Multiome受託解析サービス

10x GenomicsおよびBD Biosciences Rhapsodyプラットフォームのシングルセルマルチオーム解析 (scRNA-Seq/scATAC-Seq)

Active Motifでは、10x Genomicsおよび BD Biosciences Rhapsodyプラットフォームを用いた2種類のシングルセルマルチオーム受託解析サービスを提供しています。適切なプラットフォームの選択は、研究目的、スケール、実験デザインによって異なります。どちらのアプローチも、同一細胞から遺伝子発現 (RNA) とクロマチンアクセシビリティ (ATAC) を同時に解析することが可能ですが、ワークフロー、マルチプレックス性能、コスト効率などに違いがあります。右の比較では、それぞれのシステムの主要な特長を示しています。

カテゴリ 10x Genomics Multiome BD Biosciences Rhapsody Multiome
基本原理 ドロップレット方式 (GEMs) マイクロウェル方式
マルチオーム測定方式 同一GEM内でRNA+ATACを同時解析 同一細胞由来でRNA、ATACを分離ライブラリとして取得
トランスクリプトーム 全トランスクリプトーム解析 全トランスクリプトーム解析
ATACカバレッジ ゲノムワイド ゲノムワイド
バーコーディング セルバーコード+UMI(ドロップレット内) セルバーコード+UMI(マイクロウェル内)
マルチプレックス なし 抗体オリゴによるサンプルタグ付け (4サンプルまで)
ダブレット検出 限定的 装置イメージングにより検出
リード数 (RNA/細胞) 約25,000リード 約25,000リード
リード数 (ATAC/細胞) 約25,000リード 約25,000リード
コスト/サンプル 低~中
バイオインフォマティクス Cell Ranger ARC BD Single Cell解析パイプライン

10x Genomics認定サービスプロバイダーによるシングルセルマルチオーム解析 (ゲノムワイドな遺伝子発現およびオープンクロマチン解析)

コストパフォーマンスに優れたマルチプレックス対応のシングルセルマルチオーム解析 (scRNA-Seq/scATAC-Seq)