Cart
Products
High-Throughput ATAC-Seq Express Kit Overview
関連製品：
- ATAC-Seq Spike-In Control ：ATAC-Seqデータセット間の変動を補正
- バイオインフォマティクス受託サービス ：キットから得られたNGSデータを使用したカスタムバイオインフォマティクス解析サービス
- ATAC-Seq 受託解析サービス ：新鮮な細胞およびホルムアルデヒド固定サンプル（細胞）からのEnd-to-EndのATAC-Seq受託解析サービス
- ATAC-Seq Workshops ：エピゲノミクスに関する専門知識を深めるための、実践的な対面ワークショップを開催
Active Motif High-Throughput ATAC-Seq Express Kitは、96反応ハイスループットフォーマットで、迅速、再現性、拡張性に優れたクロマチンアクセシビリティプロファイリングを実現するように設計されています。最新のエピゲノミクスワークフロー向けに設計されたこのキットは、最小限の作業時間で効率的なNGSライブラリー調製を可能にし、高品質で再現性の高いデータを安定して取得できます。
このキットは、Pre-Indexed Assembled Tn5 Transposome（Cat. No. 53152）とATAC Buffer Set（Cat. No. 53153）を統合し、効率的なタグメンテーションとライブラリー調製に最適化されたシステムです。 Pre-Indexed Assembled Tn5 Transposomeを使用することで、カスタムアダプターのロードやタグメンテーション後のインデックス付与ステップが不要になり、マルチプレックスシーケンスワークフローや自動化プラットフォームとの連携が容易になります。
さらにキットには、Q5 Polymeraseやライブラリー精製試薬（Cat. No. 53159）など、サンプル調製、タグメンテーション、増幅、ライブラリー精製に必要な試薬がすべて含まれています。96種類の細胞または組織サンプルに対応した、完全なハイスループットATAC-Seqソリューションです。高品質なデータを維持しつつ、大規模解析にも対応できます。
一方、キットは96ウェル用に設計されていますが、Pre-Indexed Tn5 Transposomeを含む８連ウェルに分割することで、サンプル数をカスタマイズすることも可能です。従来のATAC-Seq Express kitと異なり、インデックスを組み込むための個別のピペッティングステップが不要となり、マルチチャネルピペットやロボット自動化システムとの完全な互換性を実現しています。標準化されたフォーマットにより、サンプル間のばらつきが最小限に抑えられ、高いサンプル処理能力を実現し、実験設定が簡素化されます。そのため、大規模研究、スクリーニングアプリケーション、コア施設での運用に最適です。
Active Motif High-Throughput ATAC-Seq Express Kitは、スピード、拡張性、パフォーマンスを単一の統合ワークフローに組み合わせることで、研究者が高品質なATAC-Seqライブラリーを、自信をもって、再現性高く、効率的に作製できるようサポートします。
特長：
- サンプル調製からタグメンテーション、増幅、ライブラリー精製までを網羅した、完全なハイスループットATAC-Seqソリューション
- ハイスループットワークフローにおいて、高品質なATAC-Seq解析を実現
- 単離された核、細胞、または組織サンプルに対応
(Click image to enlarge)
High-Throughput ATAC-Seq Express Kit Contents
- Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomes, store at -20°C
- P5 Primer (25 µM), store at -20°C
- P7 Primer (25 µM), store at -20°C
- ATAC Lysis Buffer, store at RT
- 2X Tagmentation Buffer, store at -20°C
- 1% Digitonin, store at -20°C
- 5X Q5 Reaction Buffer, store at -20°C
- dNTP Mix (10 mM each), store at -20°C
- Q5 DNA Polymerase, store at -20°C
- SPRI Beads, store at 4°C
- Silica Beads, store at 4°C
- DNA Purification Binding Buffer, store at RT
- DNA Purification Elution Buffer, store at RT
- DNA Purification Wash Buffer, store at RT
High-Throughput ATAC-Seq Express Kit Data
(Click image to enlarge)
図 1. High-Throughput ATAC-Seq Express：高品質データをスケーラブルに提供
50,000 個のK562 細胞を対象に、High-Throughput ATAC-Seq Express kit (紫色のトラック) とATAC-Seq Express Kit (金色のトラック) を使用した結果をIGV ブラウザーで示した。キット間で同様のピーク強度とプロファイルが得られたことから、ハイスループット法も、 従来法と同様に高品質な解析データを得られることが示された。ここでは、例としてChr19: 42,294,351-42,329,349 の領域を表示している。
(Click image to enlarge)
図2：Pre-indexed Assembled Tn5 Transposomesで得られるATAC-Seq結果は標準Tn5と一致
50,000個のK562細胞を、Pre-Indexed Tn5 Transposome（上4トラック）と従来のキットで使用されているインデックスなしAssembled Tn5 Transposome（下トラック）を使用してATAC-Seqを行った。結果は、両者間で一致した。ここでは、例としてChr6: 159,668,373-159,821,466の領域を表示している。
(Click image to enlarge)
図 3: i5/i7インデックスプライマーの組み合わせは一貫した結果を示す
50,000 個のK562 細胞を用いてPre-Indexed Tn5 Transposomeを使用した ATAC-Seq 解析を2 回繰り返した。i5 および i7 インデックス付きプライマーの各種の組み合わせは、一貫した結果が得られるように最適化して使用した。結果、フィルタリングされたピークの数と FRIP スコアは、2回の実験で大きな差がなく、すべてのインデックスの組み合わせで再現性が確認された。
(Click image to enlarge)
図4：Pre-Indexed Assembled Tn5 Transposomesは、異なる細胞株間で互換性を持つ
100,000個のHEK293、K562、HeLa、およびGM12878細胞を、Pre-Indexed Assembled Tn5 Transposomeを用いてATAC-Seqでアッセイした結果を示す。IGVブラウザに示したように、Chr19: 41,855,000-41,890,000の範囲で、一貫したピーク強度が得られた。
High-Throughput ATAC-Seq Express Kitの資料
こちらもご参照ください：
| Name | Format | Cat No. | 価格 (税抜) | |
|---|---|---|---|---|
| High-Throughput ATAC-Seq Express Kit | 96 rxns | 53158 | ¥481,000 | Buy |
